El Subprograma Ciencia Joven, el cual nace el año 2003, promueve entre los estudiantes universitarios el conocimiento de la región de Campos de Hielo en la Patagonia chilena.

A partir del año 2014, el Subprograma posiciona sus actividades de manera bianual, debido a las exigencias académicas y para garantizar de este modo un tiempo óptimo para el desarrollo de las investigaciones de los participantes, enfocándose así, en fomentar y potenciar el desarrollo de tesis de pregrado en el área geográfica donde se lleva a cabo el Programa Matriz “Cono Sur”. En este contexto, se realizan las expediciones con los estudiantes a los tres ejes de penetración a la meseta englaciada: Villa O`Higgins, Caleta Tortel y Puerto Edén, con el propósito de crear conciencia en la juventud de la necesidad de valorar e integrar efectivamente al país un extenso territorio que aún permanece casi despoblado.

Este Subprograma es un aporte al desarrollo de investigaciones en un territorio aislado, poco explorado y estudiado, en convenio con la Corporación Nacional Forestal, CONAF, Universidades y Municipios de las localidades situadas en la periferia de Campo de Hielo Patagónico Sur.